Loïc Paulevé propose de « Concilier une modélisation qualitative, abstraite et qui passe à l’échelle pour les réseaux biologiques »
La prédiction de processus biologiques complexes, tels que la différentiation cellulaire, nécessite la prise en compte de nombreux éléments moléculaires et génétiques, pour lesquels nous possédons principalement une connaissance globale sur leurs interactions deux à deux.
La modélisation dite "logique", en particulier avec les réseaux booléens, est largement employée pour raisonner sur la dynamique qualitative des réseaux biologiques, comme les réseaux de signalisation et de régulation génique. En effet, la spécification d'un réseau booléen nécessite peu de paramètres et permet de rapidement mettre en œuvre un modèle informatique pour prédire le comportement "à gros grain" d'un système biologique.